De nos jours, la gestion des ressources naturelles basée sur les méthodes modernes de conservation a montré ses limites, ce qui oblige les gestionnaires à se tourner vers les savoirs locaux. La présente étude, basée sur des enquêtes ethnobotaniques, des relevés phytosociologiques et dendrométriques a été entreprise afin d’analyser les stratégies de gestion et, de fournir des données fiables sur la flore et la végétation des bois sacrés. Ce travail a été conduit dans les 4 secteurs phytogéographiques du Burkina Faso dans le but de montrer l’importance des bois sacrés dans la conservation de la biodiversité. La prospection d’ensemble du territoire a permis de recenser 1206 bois sacrés au nombre desquels 403 ainsi que leurs formations adjacentes ont fait l’objet d’inventaire pour mieux apprécier l’état et la dynamique de la biodiversité. Au total 417 relevés phytosociologiques (bois et terroirs) ont été réalisés pour l’inventaire floristique suivis d’analyses multivariées: CAP, PC-ORD (IndVal) et CANOCO (DCA). Un inventaire quantitatif de la strate ligneuse (adulte et juvénile) a été associé à ces relevés et a consisté au comptage des individus et à la mesure de leur hauteur et de leur diamètre. La dynamique d’évolution des communautés végétales des bois a été évaluée à travers la structure de leurs peuplements et de leurs espèces dominantes. Des enquêtes ethnobotaniques ont été menées sur les techniques locales de gestion et de conservation des bois sacrés. Les résultats de l’analyse floristique montrent une richesse floristique assez considérable des sites sacrés avec 470 espèces réparties en 284 genres et 74 familles, soit 24,54 % de la flore nationale. La flore des formations adjacentes constituée de 287 espèces réparties dans 189 genres et 61 familles représente 14,98 % de la flore nationale. Les espèces les plus fréquentes dans les relevés sont peu nombreuses tandis que celles les moins fréquentes sont très nombreuses. Vingt six (26) groupements végétaux ont été discriminés en fonction des paramètres topo édaphiques, dont 5 dans le secteur sahélien strict, 6 dans le sub-sahel, 6 dans le nord soudanien et 9 dans le sud soudanien. Les bois sacrés totalisent 16 groupements végétaux contre 10 pour les terroirs. Les enquêtes ethnobotaniques menées sur la population locale ont permis de distinguer plusieurs catégories de bois sacrés: des bois fétiches, des bois de cimetières, des bois fétiche-cimetières, des bois de divinités et des bois hantés. Ils assurent des fonctions religieuses, socioculturelles, magiques et écologiques. Leur gestion est soumise à des règles, des principes et de législations coutumières. Selon la superficie, on distingue les bois miniatures (superficies inférieures à 1 hectare), les petits bois (superficies comprises entre 1 et 5 hectares), les bois moyens (superficies comprises entre 5 et 20 hectares) et les grands bois (superficies superieures à 20 hectares). L’ensemble des bois sacrés étudiés totalisent une superficie de 2081,3ha. Les enquêtes ont également permis de recenser des espèces sacrées et des «espèces totems». L’analyse de la structure des peuplements multi spécifiques et des espèces dominantes montre des structures de populations stables dans les bois hantés, les bois de cimetières et les bois fétiche-cimetières ainsi que des structures de populations dégradées dans les bois fétiches et les bois de divinités. Les bois sacrés sont donc des exemples de traditions locales qui contribuent à la sauvegarde de la flore. Mots clés: Bois sacrés, Phytosociologie, Ordination, Structure, Ethnobotanique, Burkina Faso